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14倍!用“肺”呼吸的鱼有最大基因组

2021-01-22 15:56:41    中国科学报

澳大利亚肺鱼拥有迄今为止所测序的动物中最大的基因组。据《新科学家》报道,奥地利分子病理学研究所的Siegfried Schloissnig及同事发现,肺鱼的基因组有430亿个碱基对,大约是人类基因组的14倍。日前相关成果发表于《自然》。

它的基因组比之前的纪录保持者——美西螈大30%,后者是一种两栖动物,该团队于2018年对其进行了测序。

研究人员使用高性能的计算机测序仪拼合出肺鱼的基因组。他们使用了基因组的多个拷贝,每个拷贝都被分成小段DNA。所有的片段测序完成后,研究小组使用算法将这些片段重新组装成一个完整的基因组。

Schloissnig说,澳大利亚肺鱼原产于昆士兰州东南部,从水生过渡到陆生以来,它们在外观上几乎没有什么变化。这种动物的鳍是肉质的,呈鳍肢状。它还有一个位于背部的肺,可借此在水面呼吸。

此前,人们不清楚肺鱼或腔棘鱼(一种发现于印度洋和印度尼西亚周围的古老鱼类)是否与陆地脊椎动物(如哺乳动物和鸟类等)的关系更为密切。而新的基因组分析给出了答案:肺鱼与产生四足动物的进化路线有着更密切的联系。肺鱼在4.2亿年前分化,而腔棘鱼分化的时间更早。

“要离开水,就要适应陆地的生活方式。”Schloissnig说,“必须能够呼吸空气、闻到气味。”

从与肺和(有关节的)四肢发育相关的原始基因数量,以及对空气传播的气味的检测上来看,澳大利亚肺鱼与两栖动物相似。“从基因组的角度来看,它介于鱼类和陆地脊椎动物之间。” Schloissnig说。(文乐乐)

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